首先，經過認定的高新技術企業相對于普通企業具有很多優勢：（1）經過認定的高新技術企業可以憑借《高新技術企業認定證書》和批準文件辦理并享受國家、省、市有關的優惠政策，并且更容易獲得國家、省、市等各級下發的科研經費和財政撥款支持；高新技術企業稱號已成為企業獲得政策扶持的一個基本門檻。（2）企業為提高其科技研發管理水平，提高其核心競爭力，為其在市場競爭中提供有力的資質，就需要重視高新技術企業的認定，高新技術企業的認定不僅可極大地提升企業品牌形象，對于企業的廣告宣傳和產品招投標工程都將有非常大的幫助。（3）高新技術企業的資質認證不僅可以減免企業所得稅，對于以科技為主要內容的企業來說更是不可缺少的。

其次，申報高新技術企業可以享有很多的優惠政策：（1）一般企業的企業所得稅是按照25%征收，獲得高新技術企業的企業所得稅可以減免10%，按照15%的稅率征收。（2）申報其他政府專項資金的必要條件中包括高新技術企業資質的獲得。（3）高新技術企業資質的獲得對于企業的社會影響力具有非常重要的作用，是企業獲得市場競爭優勢的重要手段。（4）獲得高新技術企業資質后的企業，其研發投入可以獲得研發費用確認享受所得稅加計扣除的優惠。（5）企業如果經過技術合同登記的技術開發或簽訂技術轉讓合同，可以享受免征營業稅等優惠政策。

國家高新技術企業認定申報要求嚴格，如果由企業自己來操作，可能會花費很多的時間與精力而不得其所。因此建議委托具有高新技術企業認定申報資質的代理機構，在知識的代理機構的幫助與輔導下進行高新技術企業的認定，往往可以收到事半功倍的效果，并且可以大大提高新技術企業認定申報的成功率。